南开大学20世纪90年代开始发展行政管理学科，于2001年开始招收行政管理专业本科生，2003年在周恩来政府管理学院设行政管理系。现设有公共管理一级学科硕士点和一级学科博士点。在教育部第五轮学科评估中，南开大学公共管理学科的评估结果A-。本系开办行政管理、城市管理两个本科专业，其中，城市管理专业由南开大学与英国格拉斯哥大学合作办学。

行政管理系有一支阵容整齐、结构合理、科研能力强、教学水平高的师资队伍。截止到2023年底，本系有师资队伍29人，其中教授11人、副教授14人、讲师2人、助理研究员2人。

近五年，南开公共管理学科承担国社科、国自科、教育部项目共23项，各级各类项目经费超3000万元，人均超100万元；学术成果丰硕，发表CSSCI、SSCI论文300余篇，人均7.7篇。智库研究成果突出，集中在人权研究、城市治理、基层治理、数字政府、应急管理、涉台政策方面，多项资政研究获国家最高领导人批示，40多份政策建议被部委、省市采纳。获得教育部高等学校科学研究优秀成果奖2项，天津市社会科学优秀成果特等奖1项、一等奖2项、二等奖4项、三等奖2项。

行政管理系以具备爱国乐群之公德，服务社会之能力为目标，培养具有马克思主义理论素养和现代公共精神、创新意识和高尚品格，系统掌握现代行政管理学科和政府管理的理论与方法，能够胜任党政机关、事业单位、社会团体等公共部门的政策分析、组织管理、社会服务等工作，并具有基本科学研究能力的复合型高级人才。

本系学生主要学习政治学、公共管理学、法学等方面的基础知识和理论，接受公共管理理论、公共政策分析、社会调查与分析、法律、外语、公文写作等方面的教育与训练，养成批判性思维和创新意识，主动探寻公共领域管理问题，并能够融会贯通多学科知识和方法研究和解决问题。主要课程有：公共管理学、政治学原理、宪法与行政法、政府经济学、公共政策学、行政组织学、公共部门人力资源管理、行政伦理学、行政管理前沿问题、中国政府与政治、公共行政理论、公共财政与预算、城市管理学、决策统计分析、社会调查研究方法等、管理心理学、现代政府理论。